گام نخست در موفقیت پرورش ماهی به مدیریت بهداشتی آن بستگی دارد. مهم ترین ، آسان ترین و کم هزینه ترین روش جلوگیری از صدمات و ضایغات ناشی از بروز بیماری ها در یک استخر پرورش ماهی ، پیشگیری از بیماری و محافظت از ماهی ها در برابر عوامل بیماری زا است .
انتخاب صحیح آب و زمین مناسب برای پرورش ماهی ، طراحی مناسب یک مزرعه بر اساس موازین بهداشتی و بالاخره مدیریت مطلوب بهداشتی از ارکان تولید اقتصادی ماهی در یک مزرعه است.
انتقال بسیاری از عوامل بیماری زا از طریق آب انجام میگیرد ، بنابراین تامین آب از این عوامل از وظایف مهم پرورش دهنده به حساب می آید.
تعویض مناسب آب بر حسب شرایط زمانی به منظور دفع و رقیق سازی سموم و گاز های تولید شده و نیز متعادل ساختن دمای آب استخر ها .
استفاده از هرگونه دارو درمانی ، پروبیوتیک ها و محرک های ایمنی می بایست به اطلاع دامپزشک فارم انجام بگیرد.
تامین غذا از منابع کاملا بهداشتی و سالم انجام بگیرد. غذا باید در انبار های خشک ، خنک و تمیز نگهداری شود و در مورد غذا های کنسانتره به تارخ مصرف آنها باید توجه کرد. مواد و غذای ورودی به انبار بایست از نظر آلودگی به حشرات و آفات کنترل شود.